由于纤维肌痛综合症的病因不明，因此治疗方法不多。治疗方面最重要的一点是给病人解释，这种病不会造成残疾，预后良好。目前的治疗主要是改善睡眠状态，减低痛觉感受器的敏感性，解除病人的焦虑和抑郁，改善肌肉血流等。

由于这种病的精神症状较突出，而实验室检查基本都是正常的，病人又总是在诉说痛楚不适，很容易被误解为神经官能症，对这种查无实据的疾病，家人要给于足够地谅解和关心。家人的体谅能够给病人疾病康复创造良好的基础。

王振宇教授提醒，患者本人也要对疾病有一定的认识，它并不是一种功能性疾病，不会造成残疾、重要器官损伤或生命危险，因此病人不必顾虑重重，否则很容易加重症状。

治疗时不要依靠消炎阵痛类药物(如消炎痛、芬必得等)或是激素类药物，而是主要依靠自我心理调节，放松心情，解除顾虑。平日作一些体育运动，可以起到改善不良心理状态的作用，在肌肉舒缩的同时也使肌肉紧张疼痛的症状得到改善；要培养多方面兴趣，多与人交往接触，以消除抑郁焦虑情绪，夜间入睡也会更加容易。